Aquí está una lista de las mejores peleas de Naito. Para una lista de las pérdidas de Naito, consulta "Yoshitaka Naito Pérdidas".
El 7 de octubre de 2016 Yoshitaka Naito se enfrentó a Joshua Pacio en un combate titular de paja por el título ONE World Championship. Naito tenía 32 años y un récord de 12-0 (7), y Pacio tenía 20 años y un récord de 10-0 (10). Naito detuvo a Joshua Pacio por asalto 3º sumisión y defendió con éxito su título.
El 27 de septiembre de 2014 Yoshitaka Naito se enfrentó a Shinya Murofushi en un combate titular de mosca por el título Shooto World de Murofushi. Naito tenía 30 años y un récord de 8-0 (4), y Murofushi tenía 31 años y un récord de 10-3-1 (6). Naito detuvo a Shinya Murofushi por asalto 5º sumisión y se convirtió en el nuevo campeón mosca mundial.
El 17 de mayo de 2019 Yoshitaka Naito se enfrentó a Alex Silva en un combate de paja a la edad de 35. Él entró con un récord de 14-3 (7), y Silva tenía 36 años y un récord de 7-3 (6). Naito ganó la pelea por asalto 3º decisión unánime.
El 29 de noviembre de 2015 Yoshitaka Naito se enfrentó a Junji Ito en un combate titular de mosca por el título Shooto World. Naito tenía 31 años y un récord de 10-0 (5), y Ito tenía 29 años y un récord de 13-5 (9). Naito ganó la pelea por asalto 5º decisión unánime y defendió con éxito su título.
El 27 de mayo de 2016 Yoshitaka Naito se enfrentó a Dejdamrong Sor Amnuaysirichoke en un combate titular de paja por el título ONE World Championship de Amnuaysirichoke. Naito tenía 32 años y un récord de 11-0 (6). Naito detuvo a Dejdamrong Sor Amnuaysirichoke por asalto 4º sumisión y se convirtió en el nuevo campeón paja de ONE.
El 9 de noviembre de 2013 Yoshitaka Naito se enfrentó a Tadaaki Yamamoto en un combate de mosca a la edad de 29. Él entró con un récord de 6-0 (3). Naito ganó la pelea por asalto 3º decisión unánime.
El 12 de mayo de 2018 Yoshitaka Naito se enfrentó a Alex Silva en un combate titular de paja por el título ONE World Championship de Silva. Naito tenía 34 años y un récord de 13-1 (7), y Silva tenía 35 años y un récord de 7-1 (6). Naito ganó la pelea por asalto 5º decisión dividida y se convirtió en el nuevo campeón paja de ONE.
El 23 de febrero de 2013 Yoshitaka Naito se enfrentó a Takafumi Ato en un combate de mosca a la edad de 29. Él entró con un récord de 3-0 (3). Naito detuvo a Takafumi Ato por sumisión en el asalto 3º.
El 15 de diciembre de 2012 Yoshitaka Naito se enfrentó a Shota Kondo en un combate titular de mosca por el título Shooto Rookie Tournament de Kondo. Naito tenía 28 años y un récord de 2-0 (2). Naito detuvo a Shota Kondo por asalto 2º KO y se convirtió en el nuevo campeón mosca mundial.
El 8 de junio de 2013 Yoshitaka Naito se enfrentó a Atsushi Takeuchi en un combate de mosca a la edad de 29. Él entró con un récord de 4-0 (3). Naito ganó la pelea por asalto 3º decisión mayoritaria.
