Junior Jones tiene seis pérdidas contra seis oponentes en su carrera de boxeo. Para una lista de las mejores peleas de Jones, consulta "Mejores peleas de Junior Jones".
El 6 de diciembre de 2002 Junior Jones se enfrentó a Ivan Alvarez a la edad de 31. Él entró con un récord de 50-6 (29). Jones perdió la pelea por asalto 10º decisión unánime.
El 29 de abril de 2000 Junior Jones se enfrentó a Paul Ingle en un combate de pluma titulado por el título FIB. Jones tenía 29 años y un récord de 47-5 (28), y Ingle tenía 27 años y un récord de 22-1 (15). Jones perdió la pelea por asalto 11º TKO.
El 12 de septiembre de 1998 Junior Jones se enfrentó a Érik Morales en un combate de supergallo titulado por el título CMB. Jones tenía 27 años y un récord de 44-4 (27), y Morales tenía 22 años y un récord de 30-0 (24). Jones perdió la pelea por asalto 4º TKO.
El 19 de diciembre de 1997 Junior Jones se enfrentó a Kennedy McKinney en un combate de supergallo titulado por el título OMB. Jones tenía 27 años y un récord de 44-3 (27). Jones perdió la pelea por asalto 4º TKO y perdió el título OMB.
El 22 de octubre de 1994 Junior Jones se enfrentó a Darryl Pinckney a la edad de 23. Él entró con un récord de 33-2 (22). Jones perdió la pelea por TKO en el asalto 3º.
El 22 de abril de 1994 Junior Jones se enfrentó a John Michael Johnson en un combate de gallo titulado por el título AMB. Jones tenía 23 años y un récord de 32-1 (22). Jones perdió la pelea por asalto 11º TKO y perdió el título AMB.