Hernán Márquez tiene 10 derrotas contra 10 oponentes en su carrera de boxeo. Para una lista de las mejores peleas de Márquez, consulta "Mejores peleas de Hernán Márquez".
El 20 de octubre de 2018 Hernán Márquez se enfrentó a Francisco Rodríguez Jr. en un combate de supermosca a la edad de 30. Él entró con un récord de 43-10-2 (30), y Rodríguez Jr. tenía 25 años y un récord de 28-4-1 (20). Márquez perdió la pelea por KO en el asalto 3º.
El 21 de abril de 2018 Hernán Márquez se enfrentó a Jose Briegel Quirino en un combate de supermosca a la edad de 29. Él entró con un récord de 43-9-2 (30). Márquez perdió la pelea por retiro en el asalto 9º.
El 16 de diciembre de 2016 Hernán Márquez se enfrentó a Iran Diaz en un combate de supermosca a la edad de 28. Él entró con un récord de 41-8-1 (29). Márquez perdió la pelea por asalto 10º decisión unánime.
El 17 de diciembre de 2015 Hernán Márquez se enfrentó a Luis Concepción en un combate de supermosca titulado por el título AMB. Márquez tenía 27 años y un récord de 39-7-1 (28), y Concepción tenía 30 años y un récord de 33-4 (24). Márquez perdió la pelea por asalto 12º decisión unánime.
El 26 de septiembre de 2015 Hernán Márquez se enfrentó a Juan Francisco Estrada en un combate de mosca titulado por los títulos AMB (Super) y OMB. Márquez tenía 27 años y un récord de 39-6-1 (28), y Estrada tenía 25 años y un récord de 32-2 (23). Márquez perdió la pelea por asalto 10º KO.
El 14 de junio de 2014 Hernán Márquez se enfrentó a McJoe Arroyo en un combate de mosca a la edad de 25. Él entró con un récord de 37-5 (26), y Arroyo tenía 28 años y un récord de 14-0 (7). Márquez perdió la pelea por KO en el asalto 11º.
El 2 de noviembre de 2013 Hernán Márquez se enfrentó a Giovani Segura en un combate de mosca a la edad de 25. Él entró con un récord de 36-4 (26). Márquez perdió la pelea por KO en el asalto 12º.
El 17 de noviembre de 2012 Hernán Márquez, el campeón de la AMB, se enfrentó a Brian Viloria, el campeón de la OMB, en un combate titular de mosca. Márquez tenía 24 años y un récord de 34-3 (25), y Viloria tenía 31 años y un récord de 31-3 (18). Márquez perdió la pelea por asalto 10º TKO y perdió su título.
El 10 de julio de 2010 Hernán Márquez se enfrentó a Nonito Donaire en un combate de supermosca titulado por el título AMB. Márquez tenía 21 años y un récord de 27-2 (20), y Donaire tenía 27 años y un récord de 23-1 (15). Márquez perdió la pelea por asalto 8º TKO.
El 12 de marzo de 2010 Hernán Márquez se enfrentó a Richie Mepranum en un combate de mosca a la edad de 21. Él entró con un récord de 27-1 (20). Márquez perdió la pelea por asalto 10º decisión unánime.
