Francisco Fonseca tiene cuatro pérdidas contra cuatro oponentes en su carrera de boxeo. Para una lista de las mejores peleas de Fonseca, consulta "Mejores peleas de Francisco Fonseca".
El 6 de mayo de 2023 Francisco Fonseca se enfrentó a Zhora Hamazaryan en un combate de superpluma a la edad de 29. Él entró con un récord de 31-4-2 (26). Fonseca perdió la pelea por asalto 10º decisión unánime.
El 14 de febrero de 2020 Francisco Fonseca se enfrentó a Ryan Garcia en un combate de ligero a la edad de 25. Él entró con un récord de 25-3-2 (20), y Garcia tenía 21 años y un récord de 19-0 (16). Fonseca perdió la pelea por KO en el asalto 1º.
El 15 de diciembre de 2018 Francisco Fonseca se enfrentó a Tevin Farmer en un combate de superpluma titulado por el título FIB. Fonseca tenía 24 años y un récord de 22-2-1 (17), y Farmer tenía 28 años y un récord de 27-4-1 (6). Fonseca perdió la pelea por asalto 12º decisión unánime.
El 26 de agosto de 2017 Francisco Fonseca se enfrentó a Gervonta Davis en un combate de superpluma titulado por el título FIB. Fonseca tenía 23 años y un récord de 19-1-1 (14), y Davis tenía 22 años y un récord de 18-0 (17). Fonseca perdió la pelea por asalto 8º KO.