Gregorio Vargas tiene nueve pérdidas contra nueve oponentes en su carrera de boxeo. Para una lista de las mejores peleas de Vargas, consulta "Mejores peleas de Gregorio Vargas".
El 6 de noviembre de 2004 Gregorio Vargas se enfrentó a Eleazar Contreras Jr en un combate de ligero a la edad de 34. Él entró con un récord de 45-9-1 (31). Vargas perdió la pelea por asalto 12º decisión unánime.
El 11 de diciembre de 2003 Gregorio Vargas se enfrentó a Mike Anchondo a la edad de 33. Él entró con un récord de 44-8-1 (30). Vargas perdió la pelea por asalto 10º decisión unánime.
El 18 de marzo de 2000 Gregorio Vargas se enfrentó a Floyd Mayweather Jr. en un combate de superpluma titulado por el título CMB. Vargas tenía 29 años y un récord de 40-7-1 (28), y Mayweather Jr. tenía 23 años y un récord de 22-0 (17). Vargas perdió la pelea por asalto 12º decisión unánime.
El 13 de enero de 1997 Gregorio Vargas se enfrentó a Carlos Hernández a la edad de 26. Él entró con un récord de 34-6-1 (24), y Hernández tenía 25 años y un récord de 22-1-1 (13). Vargas perdió la pelea por asalto 10º decisión mayoritaria.
El 22 de abril de 1994 Gregorio Vargas se enfrentó a John John Molina en un combate de superpluma titulado por el título FIB. Vargas tenía 23 años y un récord de 29-5-1 (20), y Molina tenía 29 años y un récord de 34-3 (25). Vargas perdió la pelea por asalto 12º decisión unánime.
El 4 de diciembre de 1993 Gregorio Vargas se enfrentó a Kevin Kelley en un combate de pluma titulado por el título CMB. Vargas tenía 23 años y un récord de 29-4-1 (20), y Kelley tenía 26 años y un récord de 36-0 (26). Vargas perdió la pelea por asalto 12º decisión unánime y perdió el título CMB.
El 5 de mayo de 1990 Gregorio Vargas se enfrentó a Juan Carlos Salazar a la edad de 19. Él entró con un récord de 16-3 (11). Vargas perdió la pelea por asalto 10º decisión unánime.
El 18 de agosto de 1989 Gregorio Vargas se enfrentó a Jaime Fernandez a la edad de 18. Él entró con un récord de 13-2 (10). Vargas perdió la pelea por asalto 10º decisión por puntos.
El 28 de abril de 1989 Gregorio Vargas se enfrentó a Marco Antonio Ramirez a la edad de 18. Él entró con un récord de 11-1 (9). Vargas perdió la pelea por TKO en el asalto 6º.